$12 mil millones sin cobrar: Contraloría detecta 17.390 licencias médicas impagas en Servicio de Salud Tarapacá

La Contraloría General de la República (CGR) advirtió que el Servicio de Salud de Tarapacá (SST) no gestionó el cobro de más de $12.000 millones asociados a 17.390 licencias médicas de sus funcionarios tramitadas entre enero de 2023 y marzo de 2025.

La revisión se efectuó en el marco de las investigaciones derivadas del Consolidado de Información Circularizada (CIC) N° 9 de 2025, que alertó sobre eventuales irregularidades en licencias médicas —incluidos casos de funcionarios que habrían viajado al extranjero durante su reposo laboral—, lo que motivó el análisis de 33.736 licencias en el SST. Los resultados quedaron consignados en el Informe Final de Examen de Cuentas N° 597 de 2026.

El informe del órgano fiscalizador constata deficiencias en la gestión y registro contable de los subsidios por incapacidad laboral. En particular, la entidad auditada no registra oportunamente los montos aprobados por organismos como la Comisión de Medicina Preventiva e Invalidez (COMPIN) o las ISAPRES, dejando fuera de la contabilidad una parte relevante de los recursos pendientes de cobro.

Asimismo, la CGR verificó que, del total de subsidios recuperados, el 86% carece de un detalle claro de las licencias asociadas, y detectó una diferencia superior a $507 millones entre los registros contables y los auxiliares de cobranza del subsidio. A ello se suman inconsistencias en más de 18.000 folios de licencias médicas en el Sistema de Información de Recursos Humanos —informados por la Superintendencia de Seguridad Social (SUSESO)—, lo que dificulta el seguimiento de su tramitación y podría retrasar o impedir acciones de cobro.

El informe señala que estas deficiencias afectan la integridad de la información financiera del servicio y comprometen la oportuna recuperación de fondos públicos, atendido el carácter reembolsable de los subsidios por incapacidad laboral que deben pagar FONASA e ISAPRES al empleador.

Frente a estos antecedentes, la entidad fiscalizadora instruyó al SST iniciar acciones de cobranza por la totalidad del monto pendiente de pago por parte de las instituciones de salud previsional —FONASA e ISAPRES— en un plazo de 60 días, reforzar los controles internos y mejorar la contabilización de los subsidios por licencias médicas.

Lo anterior, según consigna el informe, sin perjuicio de que el órgano de control instruirá un procedimiento disciplinario en el Servicio de Salud Tarapacá, tendiente a determinar las eventuales responsabilidades administrativas de los funcionarios involucrados en la irregularidad descrita.

La CGR enmarcó esta auditoría en una línea de fiscalización más amplia sobre el uso de licencias médicas en el sector público, abierta tras la detección de funcionarios que registraron salidas del país mientras hacían uso de reposo médico, materia que ha derivado en exámenes de cuentas en diversos servicios a lo largo del país.